Der FC Rapperswil-Jona unterhält in der Saison 2016/17 in Zusammenarbeit mit dem St. Galler Kantonalfussballverband einen E11-Stützpunkt See-Gaster sowie ein FE12-Team, wo die besten Junioren der Jahrgänge 2005 bis 2007 im Talentförderungszentrum Rapperswil-Jona optimal gefördert werden. Darüber hinaus stellt der FCRJ zusammen mit dem Grasshopper-Club Zürich einen FE12-Stützpunkt Obersee/March in Lachen. Die einzelnen Stützpunkte messen sich regelmässig anlässlich von Turnieren gegen Stützpunktteams aus anderen Regionen. In Rapperswil-Jona finden im Herbst 2016 folgende Stützpunktturniere resp. -förderspiele statt:
Mittwoch, 28. September 2016, E11-Stützpunktturnier, ab 14.00 Uhr, Grünfeld
Sonntag, 16. Oktober 2016, E11-Förderspiel zwischen Rapperswil-Jona und St. Gallen, 10.00 Uhr, Grünfeld